Pendirian Pusat Kajian dan Pendidikan dan Pelatihan Aparatur III Lembaga Administrasi Negara (PKP2A III LAN) mempunyai riwayat yang cukup singkat namun tidak mengurangi makna sebenarnya dari sebuah Institusi. Diawali dengan pertemuan yang dilakukan oleh Asisten IV, Kepala BKD, Kepala Badan Diklat Provinsi Kalimantan Timur dengan Lembaga Administrasi Negara di Jakarta tanggal 8 Agustus 2002, yang kemudian ditindak lanjuti dengan Surat Kepala Lembaga Administrasi Negara Nomor 537/IX/1/10/2002 tertanggal 29 Agustus 2002 tentang penyampaian Pokok-Pokok Pikiran dalam Pengembangan Pusat kajian dan Pendidikan dan Pelatihan Aparatur di Samarinda.

Dengan terbitnya Surat Gubernur Provinsi Kalimantan Timur Nomor 61/7232/org, tanggal 27 Nopember 2002 perihal Persetujuan Pembentukan PKP2A Regional Wilayah Kalimantan, yang kemudian ditindak lanjuti dengan Surat Keputusan Kepala LAN Nomor 14/Kep/I/2003 jo. Nomor 173B/Kep/VIII/2003 tanggal 28 Agustus 2003, Perihal rancangan organisasi LAN, dan ditindak lanjuti Surat Keputusan Menteri Pendayagunaan Aparatur Negara Nomor B/1021/M.PAN/6/2004 tentang pembentukan PKP2A III LAN Samarinda.

Rapat persiapan Operasionalisasi PKP2A III LAN Samarinda dilakukan pada hari Senin, tanggal 18 Oktober 2004, pukul 13.00 WIB, dihadiri oleh Sekretaris Utama LAN (Elis Kantiningsih) selaku Pimpinan Rapat, Sigit Purwanto (Kepala Biro Umum), Panani (Kepala Biro POK), Supono (Kepala Bagian Kepegawaian), Tri Saksono (Kabag Perencanaan), Makmun (Kabag Rumah Tangga), Etty Kurniasih (Kabag Keuangan) dan Tim Persiapan Operasionallisasi PKP2A III Samarinda, diantaranya Desi Fernanda selaku Ketua Tim, Tri Widodo Wahyu Utomo (Sekretaris merangkap Anggota), Gugum Gumelar (Anggota Tim), Baharuddin (Anggota Tim), Aryono Mulyono (Anggota Tim).

Dan akhirnya pada bulan April 2005 ditetapkanlah para Pejabat Struktural PKP2A III LAN Samarinda, sekaligus sebagai pertanda bahwa Pusat Kajian dan Pendidikan dan Pelatihan Aparatur III LAN Samarinda (PKP2A III LAN Samarinda) yang saat ini disebut Pusat Kajian dan Pendidikan dan Pelatihan Aparatur III Lembaga Administrasi Negara (PKP2A III LAN) terbentuk dan memulai kiprahnya hingga sekarang